Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SELENOFO60613 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SELENOFO60613 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms