Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KPNA3O00505 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KPNA3O00505 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms