Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
E9PCH4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E9PCH4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
E9PCH4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E9PCH4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E9PCH4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E9PCH4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E9PCH4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E9PCH4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E9PCH4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E9PCH4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E9PCH4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
E9PCH4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
E9PCH4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
E9PCH4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
E9PCH4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E9PCH4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E9PCH4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
E9PCH4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E9PCH4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
E9PCH4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
E9PCH4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
E9PCH4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
E9PCH4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
E9PCH4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
E9PCH4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
E9PCH4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
E9PCH4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
E9PCH4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
E9PCH4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
E9PCH4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
E9PCH4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
E9PCH4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
E9PCH4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
E9PCH4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
E9PCH4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
E9PCH4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
E9PCH4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
E9PCH4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
E9PCH4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
E9PCH4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
E9PCH4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
E9PCH4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
E9PCH4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
E9PCH4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
E9PCH4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
E9PCH4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
E9PCH4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
E9PCH4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
E9PCH4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
E9PCH4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
E9PCH4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
E9PCH4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
E9PCH4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
E9PCH4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
E9PCH4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
E9PCH4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
E9PCH4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
E9PCH4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
E9PCH4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
E9PCH4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
E9PCH4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
E9PCH4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
E9PCH4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
E9PCH4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
E9PCH4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
E9PCH4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
E9PCH4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E9PCH4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
E9PCH4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E9PCH4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
E9PCH4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E9PCH4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E9PCH4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
E9PCH4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
E9PCH4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E9PCH4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
E9PCH4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
E9PCH4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
E9PCH4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E9PCH4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E9PCH4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E9PCH4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E9PCH4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E9PCH4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
E9PCH4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
E9PCH4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
E9PCH4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
E9PCH4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
E9PCH4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
E9PCH4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
E9PCH4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
E9PCH4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
E9PCH4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
E9PCH4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
E9PCH4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
E9PCH4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
E9PCH4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
E9PCH4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
E9PCH4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms