Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHANK2Q9UPX8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms