Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RRP7BPQ9NSQ0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP7BPQ9NSQ0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms