Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BATF3Q9NR55 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms