Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PFDN4Q9NQP4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PFDN4Q9NQP4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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