Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IL1RAPQ9NPH3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IL1RAPQ9NPH3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms