Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
MTMR12Q9C0I1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTMR12Q9C0I1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms