Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CIPCQ9C0C6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CIPCQ9C0C6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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