Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C9orf16Q9BUW7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms