Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BPIFA3Q9BQP9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPIFA3Q9BQP9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms