Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TREX2Q9BQ50 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms