Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TCF12Q99081 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms