Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms