Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TSNARE1Q96NA8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms