Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3RF3Q8TEJ3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3RF3Q8TEJ3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3RF3Q8TEJ3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3RF3Q8TEJ3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3RF3Q8TEJ3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3RF3Q8TEJ3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3RF3Q8TEJ3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH3RF3Q8TEJ3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms