Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms