Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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ZNF548Q8NEK5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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ZNF548Q8NEK5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF548Q8NEK5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF548Q8NEK5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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