Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAB2

KBTBD3, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD3Q8NAB2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KBTBD3Q8NAB2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KBTBD3Q8NAB2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KBTBD3Q8NAB2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KBTBD3Q8NAB2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KBTBD3Q8NAB2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KBTBD3Q8NAB2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KBTBD3Q8NAB2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KBTBD3Q8NAB2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KBTBD3Q8NAB2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KBTBD3Q8NAB2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KBTBD3Q8NAB2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KBTBD3Q8NAB2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KBTBD3Q8NAB2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KBTBD3Q8NAB2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KBTBD3Q8NAB2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KBTBD3Q8NAB2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KBTBD3Q8NAB2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KBTBD3Q8NAB2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KBTBD3Q8NAB2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KBTBD3Q8NAB2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KBTBD3Q8NAB2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KBTBD3Q8NAB2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KBTBD3Q8NAB2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KBTBD3Q8NAB2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KBTBD3Q8NAB2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KBTBD3Q8NAB2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KBTBD3Q8NAB2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KBTBD3Q8NAB2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms