Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR62

RTL4, Retrotransposon Gag-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL4Q6ZR62 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTL4Q6ZR62 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms