Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTR9Q6PD62 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms