Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BROXQ5VW32 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms