Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PXDC1Q5TGL8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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