Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q499Y3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q499Y3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q499Y3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q499Y3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q499Y3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q499Y3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q499Y3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q499Y3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q499Y3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q499Y3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q499Y3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q499Y3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q499Y3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q499Y3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q499Y3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q499Y3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q499Y3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q499Y3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q499Y3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q499Y3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q499Y3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q499Y3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q499Y3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q499Y3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q499Y3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q499Y3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q499Y3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q499Y3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q499Y3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q499Y3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q499Y3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q499Y3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q499Y3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q499Y3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q499Y3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q499Y3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q499Y3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q499Y3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q499Y3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q499Y3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q499Y3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q499Y3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q499Y3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q499Y3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q499Y3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q499Y3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q499Y3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q499Y3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q499Y3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q499Y3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q499Y3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q499Y3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q499Y3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q499Y3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q499Y3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q499Y3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q499Y3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q499Y3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q499Y3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q499Y3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q499Y3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms