Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTRK2Q16620 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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