Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LAMA4Q16363 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LAMA4Q16363 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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