Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC6Q16204 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC6Q16204 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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