Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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EFNB3Q15768 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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EFNB3Q15768 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNB3Q15768 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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