Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEBPEQ15744 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms