Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP1Q13835 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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