Protein–RNA interactions for Protein: Q13636

RAB31, Ras-related protein Rab-31, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB31Q13636 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB31Q13636 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms