Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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IFT88Q13099 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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IFT88Q13099 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
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