Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXD4Q12950 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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