Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STX4Q12846 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STX4Q12846 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STX4Q12846 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STX4Q12846 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STX4Q12846 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STX4Q12846 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STX4Q12846 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STX4Q12846 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STX4Q12846 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
STX4Q12846 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STX4Q12846 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STX4Q12846 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STX4Q12846 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STX4Q12846 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STX4Q12846 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
STX4Q12846 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STX4Q12846 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STX4Q12846 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
STX4Q12846 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STX4Q12846 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STX4Q12846 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STX4Q12846 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STX4Q12846 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STX4Q12846 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STX4Q12846 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STX4Q12846 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STX4Q12846 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STX4Q12846 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STX4Q12846 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
STX4Q12846 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
STX4Q12846 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
STX4Q12846 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
STX4Q12846 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
STX4Q12846 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
STX4Q12846 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
STX4Q12846 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
STX4Q12846 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
STX4Q12846 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
STX4Q12846 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
STX4Q12846 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
STX4Q12846 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
STX4Q12846 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
STX4Q12846 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
STX4Q12846 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
STX4Q12846 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
STX4Q12846 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
STX4Q12846 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
STX4Q12846 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
STX4Q12846 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
STX4Q12846 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
STX4Q12846 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
STX4Q12846 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
STX4Q12846 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
STX4Q12846 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
STX4Q12846 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
STX4Q12846 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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