Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TGM3Q08188 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms