Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC3A1Q07837 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms