Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
IFITM3Q01628 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFITM3Q01628 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms