Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSF1Q00613 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms