Protein–RNA interactions for Protein: P63267

ACTG2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG2P63267 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTG2P63267 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms