Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA2P62736 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms