Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSMA6P60900 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PSMA6P60900 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PSMA6P60900 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PSMA6P60900 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA6P60900 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA6P60900 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA6P60900 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA6P60900 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA6P60900 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA6P60900 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA6P60900 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA6P60900 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA6P60900 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA6P60900 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA6P60900 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA6P60900 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSMA6P60900 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms