Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC13P55735 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC13P55735 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC13P55735 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC13P55735 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC13P55735 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC13P55735 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC13P55735 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC13P55735 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC13P55735 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC13P55735 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC13P55735 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC13P55735 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC13P55735 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC13P55735 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC13P55735 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC13P55735 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC13P55735 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC13P55735 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC13P55735 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC13P55735 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC13P55735 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC13P55735 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC13P55735 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC13P55735 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC13P55735 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC13P55735 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC13P55735 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC13P55735 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC13P55735 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC13P55735 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC13P55735 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC13P55735 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC13P55735 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC13P55735 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC13P55735 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC13P55735 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC13P55735 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC13P55735 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC13P55735 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC13P55735 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC13P55735 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC13P55735 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC13P55735 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC13P55735 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC13P55735 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC13P55735 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC13P55735 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC13P55735 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC13P55735 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC13P55735 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC13P55735 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC13P55735 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC13P55735 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC13P55735 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC13P55735 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC13P55735 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC13P55735 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC13P55735 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC13P55735 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC13P55735 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC13P55735 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC13P55735 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC13P55735 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC13P55735 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC13P55735 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC13P55735 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC13P55735 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC13P55735 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC13P55735 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC13P55735 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC13P55735 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC13P55735 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC13P55735 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC13P55735 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC13P55735 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC13P55735 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC13P55735 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC13P55735 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC13P55735 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC13P55735 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC13P55735 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC13P55735 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC13P55735 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC13P55735 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC13P55735 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC13P55735 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC13P55735 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC13P55735 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC13P55735 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC13P55735 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC13P55735 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC13P55735 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC13P55735 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC13P55735 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC13P55735 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC13P55735 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC13P55735 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC13P55735 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC13P55735 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms