Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOSBP53539 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOSBP53539 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOSBP53539 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOSBP53539 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOSBP53539 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOSBP53539 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOSBP53539 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOSBP53539 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOSBP53539 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOSBP53539 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOSBP53539 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOSBP53539 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOSBP53539 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOSBP53539 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FOSBP53539 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOSBP53539 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOSBP53539 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOSBP53539 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOSBP53539 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOSBP53539 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOSBP53539 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOSBP53539 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOSBP53539 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOSBP53539 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOSBP53539 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOSBP53539 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOSBP53539 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOSBP53539 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOSBP53539 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOSBP53539 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOSBP53539 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOSBP53539 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOSBP53539 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOSBP53539 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOSBP53539 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FOSBP53539 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOSBP53539 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOSBP53539 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOSBP53539 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOSBP53539 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOSBP53539 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOSBP53539 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOSBP53539 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOSBP53539 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOSBP53539 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOSBP53539 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOSBP53539 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOSBP53539 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOSBP53539 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOSBP53539 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOSBP53539 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOSBP53539 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOSBP53539 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOSBP53539 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOSBP53539 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOSBP53539 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOSBP53539 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FOSBP53539 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOSBP53539 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOSBP53539 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOSBP53539 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOSBP53539 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FOSBP53539 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FOSBP53539 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOSBP53539 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOSBP53539 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOSBP53539 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOSBP53539 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOSBP53539 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOSBP53539 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOSBP53539 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOSBP53539 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOSBP53539 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOSBP53539 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOSBP53539 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOSBP53539 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOSBP53539 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOSBP53539 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOSBP53539 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOSBP53539 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FOSBP53539 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOSBP53539 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FOSBP53539 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOSBP53539 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOSBP53539 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOSBP53539 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOSBP53539 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FOSBP53539 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOSBP53539 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOSBP53539 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOSBP53539 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOSBP53539 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOSBP53539 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOSBP53539 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOSBP53539 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOSBP53539 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOSBP53539 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOSBP53539 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOSBP53539 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms