Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms