Protein–RNA interactions for Protein: P48775

TDO2, Tryptophan 2,3-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDO2P48775 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TDO2P48775 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TDO2P48775 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TDO2P48775 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TDO2P48775 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TDO2P48775 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TDO2P48775 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TDO2P48775 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDO2P48775 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDO2P48775 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDO2P48775 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDO2P48775 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDO2P48775 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDO2P48775 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDO2P48775 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDO2P48775 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDO2P48775 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDO2P48775 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TDO2P48775 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDO2P48775 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TDO2P48775 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDO2P48775 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDO2P48775 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDO2P48775 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDO2P48775 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDO2P48775 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDO2P48775 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDO2P48775 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TDO2P48775 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDO2P48775 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TDO2P48775 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDO2P48775 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TDO2P48775 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDO2P48775 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDO2P48775 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TDO2P48775 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDO2P48775 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDO2P48775 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDO2P48775 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TDO2P48775 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDO2P48775 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDO2P48775 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDO2P48775 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TDO2P48775 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDO2P48775 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDO2P48775 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDO2P48775 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDO2P48775 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDO2P48775 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDO2P48775 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDO2P48775 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TDO2P48775 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDO2P48775 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDO2P48775 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDO2P48775 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDO2P48775 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDO2P48775 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDO2P48775 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDO2P48775 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDO2P48775 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDO2P48775 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDO2P48775 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDO2P48775 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDO2P48775 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDO2P48775 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDO2P48775 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDO2P48775 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDO2P48775 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TDO2P48775 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDO2P48775 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDO2P48775 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDO2P48775 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDO2P48775 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDO2P48775 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDO2P48775 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDO2P48775 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDO2P48775 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TDO2P48775 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDO2P48775 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TDO2P48775 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDO2P48775 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDO2P48775 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDO2P48775 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDO2P48775 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDO2P48775 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDO2P48775 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDO2P48775 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDO2P48775 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDO2P48775 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDO2P48775 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDO2P48775 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDO2P48775 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDO2P48775 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TDO2P48775 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TDO2P48775 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDO2P48775 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TDO2P48775 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDO2P48775 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TDO2P48775 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TDO2P48775 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms