Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGAEP38570 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGAEP38570 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms