Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PSMB4P28070 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PSMB4P28070 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms