Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TNNI3P19429 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms