Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTLA4P16410 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
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